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三维分子建模与科学图形软件

ChemDoodle 3D

分子建模工具

用于构建、优化和查看三维化学结构,并生成分子表面、科学图形、动画及模型文件。

  • 三维分子构建
  • 分子力场
  • 科学可视化
  • 立体化学
ChemDoodle 3D 分子轨道、表面与大分子图形示意

产品介绍

Product Overview

ChemDoodle 3D 是面向三维化学结构的分子建模与科学图形工具,可构建小分子、生成三维坐标、运行力场优化,并对分子表面、轨道、对称性、立体化学、蛋白质和晶体结构进行可视化。软件还支持动画、图像输出以及多类三维模型格式导出。

  • 化学与药学研究人员
  • 分子建模用户
  • 科研绘图人员
  • 高校化学教师与学生

软件特征

Software Features

实时三维建模

在构建分子时运行优化并交互调整构象和几何结构。

多种力场与算法

提供 UFF、MMFF94、GAFF 和 VSEPR 等力场及多种优化方向。

科学图形控制

可调整模型、表面、着色、光照、投影及后处理效果。

多类化学结构

支持小分子、生物大分子、晶体和周期体系的查看与处理。

主要功能

Main Functions

三维结构构建与编辑

通过原子、键和选择工具构建或修改三维分子,并自动处理氢原子、键识别和常见结构属性。

  • 交互添加原子和化学键
  • 自动添加或管理氢原子
  • 从坐标推断共价键和键级
  • 测量距离、键角与二面角
ChemDoodle 3D 小分子模型与分子表面示意

力场优化与构象分析

使用实时优化器和多种力场调整分子几何,查看能量、原子类型和力矢量等计算信息。

  • 支持 UFF、MMFF94、GAFF 与 VSEPR
  • 提供最速下降、共轭梯度、FIRE 和 BFGS
  • 可优化单个分子或整个场景
  • 支持多核并行力场计算
ChemDoodle 3D 分子力场与实时优化界面

分子表面与科学图形

使用多种分子表示、表面类型、着色和渲染效果制作三维化学图形,并按场景控制样式。

  • 球棍、空间填充、线框等表示
  • 生成 VDW、SAS 与 SES 表面
  • 按电荷、亲脂性等属性着色
  • 配置投影、光照、阴影与轮廓
ChemDoodle 3D 分子轨道、表面与大分子图形示意

对称性与立体化学

分析点群、对称元素和原子轨道组,并识别或调整三维结构中的立体化学配置。

  • 分析点群和对称元素
  • 显示旋转轴、镜面与反演中心
  • 解析手性中心和双键构型
  • 从二维或字符串输入生成三维构型
ChemDoodle 3D 分子对称性分析与可视化

应用领域

Application Areas

分子结构建模

用于构建小分子并生成或调整三维坐标和构象。

科研图形制作

用于生成分子、表面、轨道和生物大分子三维图形。

力场与几何优化

用于使用多种力场开展分子几何优化和能量检查。

立体化学与教学

用于查看构型、VSEPR 几何、对称元素和分子轨道。

蛋白质与核酸展示

用于读取和呈现蛋白质、核酸及相关大分子模型。

晶体与三维打印

用于处理周期结构、晶胞、纳米管并导出三维模型文件。

常见问题

Frequently Asked Questions

ChemDoodle 3D 可以完成哪些工作?

可用于三维分子构建、几何优化、科学可视化、动画和模型文件导出。

包含哪些分子力场?

公开功能页列出 UFF、MMFF94、GAFF 和 VSEPR 等力场。

是否支持分子表面和轨道显示?

支持多类分子表面、属性着色和原子轨道模型显示。

可以分析对称性与立体化学吗?

可分析点群和对称元素,并处理手性中心、双键及累积双键体系的构型。

当前版本和系统要求如何确认?

当前版本、支持平台、OpenGL 要求、文件格式和许可条件应在使用前按当前说明确认。