地下水模拟系统(Groundwater Modeling System)，简称GMS，是美国Brigham Young University的环境模型研究实验室和美国军队排水工程试验工作站在综合MODFLOW、FEMWATER、MT3DMS、RT3D、SEAM3D、MODPATH、SEEP2D、NUFT、UTCHEM等已有地下水模型的基础上开发的综合性用于地下水模拟的图形界面软件。

Visual MODFLOW Flex是模拟三维地下水水流，热传递和污染物运移的标准化软件。该软件实现了概念模型和数值模型的转化，具备的二维和三维可视化功能，易于操作。

RockWorks软件是一款地质建模和数据分析软件，具有强大的3D可视化和地质分析功能，为地质工程师和环境科学家提供了全面的工具和解决方案。

PetraSim是用于TOUGH2模拟程序家族的图形化界面。TOUGH2及其衍生程序由伯克利劳伦斯实验室研发，因其在孔隙和裂隙介质中多相流和热运移的模拟能力而被认可，挥发性有机化合物的多组分混合物（TMVOC）模块。