如何使用Sequencher软件查看DNA序列
Sequencher是DNA序列分析的软件。它可以和自动序列分析仪一同工作,并且因为它可以Contig组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具,以及技术而被周知。
使用Sequencher软件查看DNA序列
使用Sequencher的方法步骤:
A、查看峰图或编辑
-
打开软件
-
载入文件(abl格式)
-
双击打开文件,可见序列信息
-
点击右上角的“show chromatogram”可见峰图
B、整合多个文件,存为文件:
-
打开文件
-
载入文件夹import
-
选中文件,点击file下的export导出,选择“selection as subproject”,弹出保存的对话框,命名保存文件并选择格式(txt)。
该txt文件可用clustal x打开,进行序列比对,保存为aln格式后,可以不用bioedit打开进行编辑修改。
注:Sequencher软件的主要功能为序列查看。序列比对可用MEGA操作,编辑更方便,比对时间稍短。
Poly结构后双峰问题:
Poly A/T结构通常致其后的峰图出现重叠峰,PolyG/C结构通常致其后的峰图出现信号衰减。Poly结构是测序失败常见的原因之一,目前还没有很的方法解决Poly结构的影响,但而言,PCR样品Poly结构后双峰的概率很高,而菌液中Poly结构对测序结果的影响较少或没有。
解决办法:
-
反向测序再拼接
-
连接到载体后测序
也有一些Poly结构对测序影响较低。
2020-02-27 06:07
-
Secure Desktop - 安全桌面软件
安全桌面是在公共区域运行的计算机设计的软件。使用安全桌面替换开始菜单、任务栏和桌面图标,可以锁定窗口,禁用程序, 为公共互联网提供的端点安全解决方案。¥ 0.00立即购买
-
MicroShield® - 辐射剂量计算软件
MicroShield®是一款辐射剂量计算软件,它广泛应用于屏蔽体设计与屏蔽外参考点剂量率计算等方面。 该软件有16种源项模型并自带含12种屏蔽材料的材料库以及含大量放射性核素的核素库,用户还可以根据工程需要自行添加屏蔽材料,这些功能使用户在建模时有更广泛的选择范围。¥ 0.00立即购买
-
Space Radiation - 空间辐射环境及效应分析软件
Space Radiation 空间辐射环境及效应分析软件是广泛使用于所要计算的模型暴露于下述空间环境的防辐照设计工具。新版本为V7。¥ 0.00立即购买
-
Earth Volumetric Studio(EVS)- 可视化地质建模软件
Earth Volumetric Studio是美国C Tech公司受欢迎的软件包,增加了高等网格模块、建模工具、输出选项、地质统计分析、 动画分析、GIS功能等。¥ 0.00立即购买
-
NVivo 12 - 定性(质性)分析软件
NVivo 12 是定性和混合方式搜索的软件, 它是为了帮助您整理、分析和找到对非结构化或定性数据的深刻见解而设计的。护理,公共健康,心理学,教育等研究人员处理定性数据时,NVivo软件是比较合适的选择。¥ 0.00立即购买