使用Beacon Designer设计多重实时PCR引物和SYBR® Green PCR引物

 

多重实时PCR引物设计

 

设计能够有效且准确定量的多重引物探针组是一项具有挑战性的任务。Beacon Designer™ 使用创新的专有算法,能够为单管多重检.测设计蕞优的引物-探针组,蕞多支持5个目标。所有引物-探针组都会经过交叉兼容性和与其他目标的交叉同源性分析,以确保特异性和快速的扩增。如果您希望在检.测中包含经过验证的引物组,或包括用于标准化的参考基因或管家基因,Beacon Designer™ 也可以完整地支持您的需求。

 

SYBR® Green PCR检.测

 

Beacon Designer™ 设计的SYBR® Green PCR引物对具有高度的特异性,并能够快速扩增目标区域。这些SYBR® Green引物在设计时,会避免序列与数据库序列中显示出的显著同源区域。为了验证所设计的SYBR® Green PCR检.测的特异性,您可以将引物在NCBI的nr数据库中进行BLAST搜索,该数据库包含所有可用的基因组数据库。

 

该工具的另一个独特功能是自动避免阻碍SYBR® Green引物延伸的二级结构。模板在二级结构区域会形成环,这种环会阻止PCR产物的形成。

 

您可以使用预设计的、已发表的或经过验证的前向或反向引物,Beacon Designer™ 会为您评估这些引物。例如,对于给定的前向引物,Beacon Designer™ 可以为SYBR® Green检.测设计反向引物(同时可以为TaqMan®检.测设计反向引物和探针)。所有引物都会根据排名算法进行评分,评分依据是指定的引物对和引物搜索参数与目标值的匹配程度。

 

 

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2024-09-05 14:00
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