Chenomx NMR软件中的光谱处理与参考选择方法
本文介绍了Chenomx NMR软件中关于光谱处理和参考选择的常见问题解答,包括自动光谱对齐、FID文件导入、化学位移参考(CSI)选择及校准问题等。
一、是否可以在Chenomx中自动对齐光谱?
光谱的自动对齐通常是通过蕞显著的峰进行的,但这种方法在生物体液中呈现较差,因为这些液体中通常具有较高的特殊峰密度。因此,自动对齐方法可能在生物体液样本中不适用。
二、建议导入FlD文件还是1R文件?
我们强烈建议直接从FID文件夹导入原始的FID文件。这种方式可以确保数据的完整性和准确性。
三、为什么我的DSS没有定位在0.0ppm?
Chenomx软件会自动将DSS信号定位到0ppm。如果你的CSI没有定位在0ppm,可能是你使用了不同的CSI(例如TSP)。TSP的位移依赖于pH值的变化,因此与DSS不同,其化学位移会随pH的变化而变化。
四、为什么在处理和校准后我的光谱似乎偏移了大约0.01ppm?或者当我使用TSP作为CSI时,TSP峰没有定位在0ppm?
Chenomx化合物库基于DSS的特性,DSS的化学位移不受pH值的影响,而TSP的化学位移会随着pH值变化。当你选择TSP作为CSI时,光谱会被重新校准,以使其与使用DSS采集的数据进行比较,从而确保与化合物库的准确匹配。这会导致光谱偏移约0.01ppm,这虽然看起来与传统的TSP 0ppm参考方式有所不同,但它能够确保在使用TSP校准的同时,准确地校准与化合物库的比较。
五、如何处理没有CSI的光谱?
我们建议为所有准备使用Chenomx NMR Suite分析的样本添加支持的CSI(目前支持DSS、TSP和formate)。如果你的样本没有CSI,可以尝试以下方法:
在打开没有CSI的光谱时,可以选择“none”作为CSI选项,软件将尝试自动确定参考位置。
尽管如此,建议手动校准光谱,选择一个已知的峰作为参考。在Processor中加载光谱后,可以通过调整x轴位置来手动校准。
当手动引用光谱时,需要注意以下几点:
1. 使用Profiler测量的化合物浓度可能不准确,但相对浓度仍然合理。例如,如果测量乙酸的浓度为1 mM,丙氨酸的浓度为2 mM,这些数值可能不会反映样品中化合物的真实浓度,但可以推断丙氨酸的浓度是乙酸的两倍。
2. 在某些情况下,变换窗口可能不适合所有化合物,你可能无法将某些峰精准地调整到期望位置。为了进一步优化手动参考,可以使用Jump to Processor功能,调整CSI位置,并返回Profiler继续分析。