Spartan 分子建模软件包18版本已正式发布

本文由睿驰科技翻译整理

Spartan 18中新增功能如下：

新的GUI相关功能：

· 增强2D草图和3D构建器之间的协作，从3D到2D（至多250个原子）的转换功能，过渡箭头的识别

· 通过数据的切换开关增强OUTPUT摘要和查看选择

· 引入构象分析和NMR分析的配方：可以使用多个计算引擎设置多步计算

· 将2D，3D图表粘贴到光谱平移和绘图平移

· Molecular Utility的原子重定位功能

计算的新扩展：

· 并行处理16个线程：(大约64个线程和大约40倍的单核）*Gt16版本

· Hartree-Fock和DFT的IR计算的并行处理

· 添加七个或更多成员的环构象分析规则

· 引入可由用户更改的多级构象分析配方

· 介绍柔性分子的NMR分析方法：化学位移值加权和存在概率平均

· DP4

· 基本系列PCJ-0，PCJ-1，PCJ-2，用于耦合常数计算

使用Spartan 18可计算出的属性：

-原子电荷：由于静电势分布的适应性，Mulliken的充电，NBO的充电，充电

-热力学常数：根据分子结构和振动计算计算熵，熵，自由能，同位素效应。

-静电：α，β和γ项

-酸度/碱度：计算酸度，常见羧酸和胺的碱度

-附加属性：分子量，表面积，体积，对称，HOMO，LUMO能级，PSA，区域，的LogP，圆度，Q型减，Q-另外，电负性，硬度

-红外光谱：输出IR（分子振动）计算结果作为红外光谱图，读取实验值，重写，拟合函数到实验值。动画显示振动模式

-溶剂效果：C-PCM，SS（V）PE，SM 3，SM 6，SM 5.4，SM 5.0 R，SM 8，SM 12

-NMR计算：Hartree-Fock法和DFT模型的化学位移校正和配方介绍

-紫外/可见光谱：CIS / CIS（D）或TDDFT

Spartan 18 配备的计算方法：

-分子力场：在获得大分子结构或柔性分子的构象分析的情况下，分子力场可以说是现实的方法。

force field参数实现两种类型的SYBYL力场和MMFF 94力场，SYBYL扩展为周期表中的元素。MMFF 94参数化以再现有机分子和生物聚合物的结构和构象。

-半经验分子轨道：半经验分子轨道计算是的量子化学方法，可用于确定平衡和过渡态的结构或能量。是在PM3中，过渡金属元素等被扩展，并且它可以应用于诸如这种原子种类的无机或有机金属配合物的模型。Spartan '06 for Windows三种AM1，PM3，MNDO和MNDO / d，具有d轨道扩展作为典型元素的一部分。PM3几乎可以处理过渡元素。

它AM1，PM3，MNDO，RM1，PM6五种方法。

方法（并行处理可用于蓝色字母的 Parallel Suite，并行处理适用于GT 16）

-Hartree-Fock 分子轨道：Hartree-Fock分子轨道计算可用于计算分子结构，能量和性质，对计算有机分子。它标准的基础功能，例如以下：STO-3G，3-21G，6-31G *，6-311G *，CC-pVDZ，CC-pVTZ和CC-pVQZ，（d），（ d，p），（2d）的，（2D，2P），（2DF，2DP），（3D，3P），（3DF，3DP）每分机，或单独的p轨道和d轨道指定的可能的延伸赝势也可用于含有重元素的系统中。Spartan还可以导入和添加基本功能，或者您可以使用用户定义的基本功能。还引入了双基础集。基于扰动理论的多个基函数的组合提高了计算精度和速度。

Spartan 18 任务的种类：

-能源：计算总能量（Hartree-Fock，DFT方法，Molller-Preset，高阶电子相关），生成热（半经验方法）和失真能量（分子力场）。

-均衡结构：执行结构以获得局部数值小值。

-迁移状态结构：寻求转变结构，作为该选项可以进行固有反应坐标分析

-IR谱：使用MP3，MP4和除高阶电子相关性之外的方法可以进行振动计算

-核磁共振谱：通过Hartree-Fock和DFT方法计算化学位移COZY NOESY图创建可能性HH耦合常数

-拉曼光谱：Hartree-Fock和DFT

-紫外/可见光谱：Hartree-Fock / CIS和DFT / TDDFT

-构象分析：创建可能稳定的星座列表，并单独保存稳定的结构。添加了生成库以覆盖具有较小构象异构体的构象空间的功能。（用于分子的性能分析）

-能源概况：指定的内部坐标系并计算能量以创建配置文件。它有助于沿反应坐标系搜索过渡结构和由于构象的能垒。也可以对多个参数进行网格扫描。

-分子性分析：通过分子评分分析分子或药效团之间的性能。在分子的情况下，您可以选择通过分子结构评分或通过CFD评分。