CodonCode Aligner 12.0 新功能发布：虚拟克隆、特征转移及Bug修正

CodonCode Aligner 12.0 版增加了一项新功能，可以在序列之间转移特征;三种新的虚拟克隆方法：定向TOPO克隆、平末端PCR和TOPO克隆、TA克隆;能够在Contig概览中查看特征;和多个bug修正。

请注意，CodonCode Aligner12需要新的许可证密钥。版本12是截止到2024年12月3日具有当前更新和支持协议的所有用户的免费升级。其他客户可以购买升级到版本12。

更多虚拟克隆方法

除了现有的限制性克隆和Gibson Assembly模拟器外，CodonCode Aligner 12.0还引入了TA克隆、定向TOPO克隆以及平末端PCR和TOPO克隆。

载体 - 平末端克隆

引物 - 定向 TOPO 克隆

产品 - TA 克隆

所有序列都可以以显示要素和剪辑地点的地图样式显示，也可以显示在基础级别。您可以使用克隆视图左侧的工具栏按钮自定义要显示的剪辑站点和功能。底部的图形概述显示了您的载体、片段、引物和产物。

从已包含的常见克隆载体中进行选择，或使用您自己的自定义载体。

根据您的 Tm 设置自动选择更佳引物。您还可以手动编辑引物，例如添加垫片或根据需要调整阅读框。

选择直接导出引物和片段，以及应创建克隆实验中的哪些序列并将其添加到您的CodonCode Aligner项目中。

传输功能

在样品之间传输特征（标签）从未如此简单。只需选择两个序列，然后选择要查找的特征的蕞小%同一性。还可以手动调整要传输的已找到的要素。

上面的示例显示了查找和注释具有起码95%同一性的常见特征之前和之后的向量。

请参阅 Contig 概述中的功能

在 Aligner12中，您现在可以在contig概览的箭头中看到特征（标签）。这样可以轻松比较序列之间的特征。鼠标悬停可显示详细的功能信息，您可以自定义箭头大小以及应显示的功能。

CodonCode Aligner 12.0与Windows 11和macOS Sequoia（15）兼容。