DNASTAR Lasergene 18.1基因组学套件升级：增强变异分析、蛋白质建模与工作流

DNASTAR Lasergene 18.1 引入了基因组学、分子生物学和蛋白质分析领域的强大新功能，并对整个套件的可用性和性能进行了改进。此版本提供了基于GATK的新工作流以扩展变异验测功能、SeqMan Ultra中的多样本Sanger组装、采用Boltz-2模型的新一代蛋白质相互作用建模、先进的异构体分析，以及SeqBuilder Pro中对本地数据库BLAST的新支持。这些增强功能共同为研究人员在分析的每个阶段提供了更高的准确性、速度和信心。

变异分析
长读长与RNA分析
基因组可视化与变异探索
Sanger组装
蛋白质结构与相互作用
数据库与搜索
工作流访问与实用工具
其他增强功能

变异分析

通过Lasergene Genomics中的行业标准工具和新可视化功能，获得对生殖系和体细胞变异的更深入洞察。

利用GATK的HaplotypeCaller进行高质量的生殖系变异发现。
使用GATK的Mutect2体细胞变异验测工具分析配对肿瘤/正常或仅肿瘤数据集。
利用新的gnomAD VCF过滤功能增强仅肿瘤分析。
在GenVision Pro中使用新的"分析"视图比较多个配对肿瘤-正常实验，该视图允许您并排可视化肿瘤和正常样本的比对情况。

长读长与RNA分析

释放Lasergene Genomics中长读长测序和RNA-Seq的强大功能，以捕获异构体、转录本和结构复杂性。

组装长读长RNA-Seq数据，实现完整的mRNA分析。
执行Iso-Seq比对和可视化，以改进转录本发现。
在GenVision Pro中新增的专用比对轨道中探索mRNA异构体。

基因组可视化与变异探索

借助GenVision Pro中新增的多样本支持和增强的可视化与过滤功能，更快地查看、解读和分享您的结果。

通过新支持的每个项目顶多50个人类外显子组以及针对大规模变异分析的扩展数据轨道可视化，在一个项目中分析多个样本。
强大的变异过滤功能允许您限制"变异"表格和"分析"视图轨道，仅显示您感兴趣的变异。
可按染色体过滤显示的变异，并可进一步使用22个预计算过滤器（包括Mutect2特定值，如GERMQ、MMQ或POPAF）来精炼结果，帮助区分体细胞与生殖系变异。
通过增强的分裂读段显示更好地理解结构变异。
将变异导出为VCF格式以供下游使用。

Sanger组装

SeqMan Ultra现在支持多样本Sanger组装，让您可以在经典的SeqMan工作流和基因组学驱动的方法之间灵活选择。

在SeqMan Ultra中使用SeqMan算法组装多样本Sanger数据，其用户界面与经典的SeqMan Pro相似。
或者，使用SeqMan NGen运行多样本Sanger组装，将Sanger数据比对到人类染色体，并可访问面向基因组学客户的高级变异分析工具，例如VAD。

蛋白质结构与相互作用

Protean 3D现在包含超快速、准确的蛋白质相互作用建模，拓展了可用于结构生物学研究的分析范围。

使用新的Boltz-2模型建模蛋白质与DNA、RNA和小分子的相互作用。Boltz-2是AlphaFold 3的开源类比模型，可提供快速、准确且经济有效的结果。它能准确预测整个蛋白质复合物，包括多个蛋白质亚基、DNA结合位点和小分子配体。

数据库与搜索

更有效地管理和搜索您的数据，从而减少设置时间，增加分析时间。

在SeqBuilder Pro中创建和组织序列数据库，以实现快速的本地BLAST搜索，此功能现已加入GenVision Pro、Protean 3D、SeqMan Ultra和MegAlign Pro已有的功能中。
对本地数据库执行文本搜索，此功能现在在所有支持本地BLAST的应用程序中均可用。
直接在SeqBuilder Pro中构建和管理用于质粒自动注释的自定义数据库。