Endeavour- 粉末衍射结构求解软件
Endeavour是一款功能强大的晶体结构解决方案软件,来自粉末以及单晶衍射数据。基于十多年的经验,该软件能够自行或多或少地解决许多中小型结构。创新的概念与精致的用户界面相结合,使得晶体结构的解决方案几乎成为常规过程,特别是对于无机化合物,但也适用于许多有 机化合物。
即使是没有经验的用户也可以在几个步骤中准备和执行结构溶液计算:只需按照集成的“向导”输入所需的数据(单元胞参数,化学成分,衍射数据),然后让Endeavour完成其余的工作。结构解是使用一种特殊的“直接空间”方法进行的,即对计算和观测的衍射数据之间的差以及系统的势能进行组合全局优化。由于额外使用了势能,该方法对低质量衍射数据的灵敏度远低于直接方法。
2018年10月11日发布的Endeavour的新版本1.8具有重新设计的用户界面,这是我们从粉末数据中解决晶体结构的软件。此新版本包含多项改进和各种错误修正:
新的“外观和感觉”
用户界面的设计已经过完善。
教程中运行RuS2和BaMoCl6示例的版本的屏幕截图
选项卡式多文档窗口界面
- 多文档界面(一次处理多个结构文档)现在具有选项卡式界面。您可以轻松单击选项卡以切换到其他文档。要并排查看两个(或多个)文档窗口,只需将相应的选项卡拖到右侧即可。当您放下标签(即松开鼠标按钮)时,半透明标记将显示目标位置。
结构解决方案进度现在在停靠窗口
- 结构解决方案进度图形现在出现在停靠窗口中,一次显示多个种子值和/或文档的图形。该窗口可以一次显示多个进度图,新的在顶部。通常,当前运行的计算在顶部,下面是以前使用种子值的计算。进度图不仅可以显示活动文档或选定文档,还可以显示所有当前打开的文档,即显示所有选项卡文档窗口。
- 您可以撕下窗口(将鼠标指针移动到窗口的标题,按下鼠标左键并移动到其他位置)并使其保持浮动, 或者您可以将其停靠在Endeavour应用程序窗口的左侧。 此窗口可以通过“关闭”按钮(右上角的十字符号)关闭。 在这种情况下,可以通过从“视图”菜单中选择“进度窗口”或单击Endeavour工具栏中的“进度窗口”按钮来再次显示进度窗口。
注: 此停靠窗口取代了以前的浮动“进度窗口”(Progress Window) 浮动“进度窗口”对话框窗口,该窗口仅在结构求解计算期间显示。
R因子和成本函数值
- 每个进度图(用于运行结构解计算)都可以在一个图中同时显示R值和成本函数值或两个值在彼此上方的两个不同图形中。您可以使用“折叠”或“展开”按钮在这两种表示形式之间切换。
帮助系统和文档的改进
- 新的基于HTML的联机帮助系统取代了过时的(在Windows Vista到10下不再受支持)“Windows 帮助”系统。
- 一个单独的手册和教程文件,包含(现已作为单独的 PDF 文件过时)“Endeavour内核脚本参考”,“文件格式”和“快速入门教程”,参见“帮助/手册和教程”。
- 新设置(当关闭Endeavour时)现在存储在Windows注册表(HKEY_CURRENT_USER\Software\Crystal Impact\Endeavour)中,而不是储存在“C:\Windows”目录下的“Endeavour.ini”文件中。
结构求解过程的改进
- 包含分子/刚体的晶体结构现在可以直接在P1以外的空间群中求解,即使它们的原子必须放置在特殊位置。
Bug修正
- “无法启动联机帮助”消息:基于“Windows帮助”(Endeavour.hlp)的过时的在线帮助系统已被新的基于HTML的在线帮助系统(Endeavour.chm)所取代。
- 在某些Windows 10系统上,当您单击一行时,例如在原子参数表或多个对话框窗口中的表中,Endeavour崩溃。
- 如果两个中性原子的距离小于蕞小距离,则两个中性原子之间的排斥力减弱。
- 即使刚体被固定在某个位置(只允许旋转),也允许交换刚体的位置。结果,看起来原本固定的分子在移动。
- 当您在不同的配置之间切换时(例如,配置列表上下文菜单中的“选择配置”指令)并且某些原子的S.O.F. <为1,这些SOF不会被复制到当前结构参数中(例如,在原子参数对话框中显示为1)。
- 在配置之间切换时,结果报告未正确更新。
- 以Ihkl格式导出衍射数据时,将Fhkl而不是Ihkl值写入输出文件。
- 还修正了几个小错误。
【英文介绍】
Endeavour is a powerful software for crystal structure solution, both from powder as well as single crystal diffraction data. Based on more than ten years of experience, the software is capable of solving many small to medium sized structures more or less on its own. The innovative concept combined with the elaborate user interface makes the solution of crystal structures an almost routine process, especially for inorganic but also for many organic compounds.
Even unexperienced users can prepare and perform the structure solution calculation in a few steps: Simply follow the integrated "wizard" to enter the required data (unit cell parameters, chemical composition, diffraction data), and let Endeavour do the rest. The structure solution is performed using a special variant of the "direct-space" approach, namely a combined global optimization of the difference between calculated and observed diffraction data and of the potential energy of the system. Due to the additional usage of the potential energy, the method is much less sensitive to low-quality diffraction data than e.g. direct methods.
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