SnapGene 8.1重磅更新：界面革新、数据管理优化与可视化功能升级

SnapGene 8.1 更新了酶视图，以提供与其他表格视图一致的简化 UI，包括对导航文件和数据管理的大量改进，将多文件作扩展到任一打开的文件以及项目搜索结果，并添加了许多新的着色选项，以增强数据的可视化。

简化的界面

在更新的酶视图中，通过简化的可扩展行轻松识别关键信息，该视图提供了增强的过滤选项和更直观的滚动。Secondary Structure（辅助结构）视图中的控件现在浮动在内容上方，并且结构列表和统计信息已现代化。

改进的搜索结果和作

实时搜索结果会在添加、重取名、修改或删除文件时更新，而改进的选择行为、筛选和排序选项允许您更轻松地识别和修改文件。

添加淡淡的色彩

许多新的着色选项允许您可视化残基及其相关的化学和跨膜特性，在侧面工具栏中找到按钮，并在明暗模式之间切换。

导航和数据管理

通过简化的文件和文件夹面板导航、注释和管理质粒，该面板现在可以对所有打开的序列文件进行查看和执行批量注释和文件转换。聚焦于区域可放大更大的序列。

详细更改

• 增强的酶视图，具有灵活、现代、简化的 UI 和可扩展的行
• “Secondary Structure”（辅助结构）视图中的现代化控件、结构列表和统计信息
• 添加了将 SnapGene 文件和元数据发送到 Dotmatics Luma 的功能
• 通过侧边的 Project and files（项目和文件）面板轻松导航和管理所有打开的文件在支持打印的对话框中添加了对 Select All 和 Copy 菜单作的支持
• 将文件和文件夹面板选择与当前聚焦的文件选项卡同步
• 添加了新选项，用于选择在 SnapGene 启动时是恢复选项卡还是重新开始
• 批量注释、模拟、编辑和管理更多质粒和其他文件
• 通过将底部的按钮和其他指令移动到上下文菜单，简化了文件和文件夹面板
• 改进了选项卡、搜索结果和文件夹面板的行为和上下文菜单选项的一致性
• 添加了隐藏文件扩展名的选项
• 将顶部栏中的“Get Started”按钮替换为“Home”按钮
• 对于大于或等于 10 Kb 的序列，将 Zoom controls 重取名为 Focus on Region（聚焦于区域）和 Restore（序列）视图中的按钮
• 为聚焦区域添加了新的键盘快捷键 （Cmd/Ctrl+Alt+Z）
• 添加了一个选项，用于在文件和文件夹面板中复制拖动的文件或文件夹，方法是在单击并拖动项目之前按 Opt/Alt 键。
• 改进了文件搜索结果的筛选和排序
• 在打开的 Project 中添加、重取名、删除或修改文件时自动刷新搜索结果
• 根据选定的搜索结果批量注释、编辑或管理您的质粒和其他文件
• 改进了搜索结果的选择行为
• 添加了对搜索结果的键盘支持，包括 Select All （Cmd / Crtrl+A）、Home、End、向上箭头、向下箭头、PgUp 和 PgDn
• 添加了在侧面工具栏中使用彩色图标的选项
• 增加了按核苷酸和嘌呤/嘧啶对核苷酸序列进行着色的选项
• 增加了通过化学性质（Zappo，Clustal X和DNASTAR）和跨膜趋势（Zhao和London）为蛋白质序列着色的选项。
• 添加了基于化学性质突出显示蛋白质比对的选项 （DNASTAR）
• 修正了各种着色方法以正确处理简并残留物
• 通过顶部栏中的选项菜单在明暗模式之间轻松切换
• 添加了在按 Alt / Opt 时关闭选项卡而不保存到选项卡栏上下文菜单和 kebob 按钮菜单的作
• 您现在可以使用 Display （显示） 按钮更改所选的酶组
• 添加了对在 Linux 上使用电子邮件登录激化 SnapGene 的支持

向 Common Features 数据库添加功能并更新

添加了用于脊椎动物细胞基因组工程的 Tol2 系统

添加了 FLP 重组酶识别位点的 FRT3 变体。

添加了 LOVTRAP 光遗传学系统的 LOV2 和 Zdk 组分，用于诱导蛋白质解离

添加了用于蛋白质纯化的 Protein C 标签

为 LexA 和 GAL4 功能添加了其他说明

修剪了小鼠免疫球蛋白 k 轻链信号肽非前导 D 密码子和切割特征，使该特征真正匹配前导序列并在切割点结束

• 添加了以下 MW 标记

安捷伦 100-3 bp DNA 分子量标准

Qiagen QX DNA 大小标记物 100 bp - 2.5 kb 分子量标准

Sigma Aldrich DirectLoad™ Plus 1 kb DNA 分子量标准

• 各种消息对话框中的现代化控件
• “信息”面板中的现代化下拉菜单和复选框
• 改进了顶部工具栏中的边距和间距
• 将 Blast Selected DNA 指令更新为默认使用较新的 core_nt 数据库

Bug 修正

• 用于打印“信息”面板的“已恢复”选项
• 确保工具提示不会部分显示在屏幕上
• 在查看文件搜索结果时减除文件和文件夹面板选择
• 修正了在日语或中文中使用 SnapGene 时自动选择默认聚合酶的问题
• 修正了在酶视图中显示较长酶组名称的问题
• 修正了打开的窗口（如 Noncutters）有时在 Window 菜单中重复的问题
• 改进了 Window 菜单中 Project 窗口的名称（如果没有文档选项卡处于活动状态）
• 修正了调整窗口大小的问题
• 修正了在文件和文件夹面板中单击并拖动项目时显示绿色加号指示器的问题，而这些项目将被移动而不是复制
• 修正了导出多个 RNA 文件时未列出导出格式的问题
• 修正了从 macOS 查找器、Windows 资源管理器或桌面将 Gel 拖动到文件和文件夹面板中的问题
• 修正了导致无法在多个序列比对中读取不明确碱基的颜色问题
• 修正了文档关闭时仍在对话框中使用时的各种错误，例如克隆、模拟琼脂糖凝胶或计算比对
• 修正了在对 Features 或 Primers 视图进行排序后渲染行分隔符时的视觉伪影
• 修正了工具提示在“功能”和“Primer”视图中立即消失的问题
• 修正了在克隆对话框中修改产品名称后，即使片段末端不兼容，有时也会错误地允许克隆继续进行的问题
• 修正了渲染某些按钮时出现的问题
• 修正了在使用深色模式时指示文件已被删除时的文本颜色，以确保消息可见
• 提高了稳定性并修正了各种内存泄漏
• 修正了 Features （功能） 和 Primers （引物） 视图中的 Find keyboard 快捷键
• 确保未保存的更改始终以黄点显示
• 修正了在 Secondary Structure 视图的右上角显示 Display 按钮的问题
• 修正了在按下并释放 Alt/Opt 键时更新菜单以显示标准和替代作的问题
• 修正了在水平滚动时，无法为“序列”视图中侧工具栏下方显示的内容选择或显示工具提示的问题
• 修正了 Remove Selected Enzyme Site 对话框中的阅读框控件
• 修正了显示一些对齐到参考的问题
• 修正了指定为仅对齐到一条链或参考序列的某个区域的选项被忽略的错误
• 修正了缩放百分比、调整结构列表大小以及查看引物二级结构时显示的其他消息的各种问题
• 修正了移动、重取名或删除的文件继续显示在主屏幕的“近来打开的文件”部分中的问题
• 确保在选择用于创建新琼脂糖凝胶的选项后激出Project 窗口
• 修正了将多行文本复制并粘贴到其他程序中的问题
• 确保注释的负位置正确显示在 Features （特征） 和 Primers （引物） 视图中
• 修正了激化SnapGene 时 File （文件） 菜单中的 Import作指示它们未解锁的问题
• 修正了阻止在多个序列对齐中打印特征的问题
• 现在，在 Features 或 Primers 视图中选择限定符其他注释属性可以减除文档选择以避免模棱两可的选择
• 修正了在不使用“项目”窗口时模拟琼脂糖凝胶时默认使用所有打开的文件而不是可见文档的问题
• 提高了模拟琼脂糖凝胶时更改 MW 标记物时的稳定性
• 在计算二级结构后将 RNA 文件标记为具有未保存的更改
• 改进了导入 VectorNTI 导出的 GenBank 文件时的稳定性
• 改进了导入 VectorNTI 数据库时的稳定性
• 修正了在 Windows 上的打印选项对话框后面显示有关打印到 PDF 的孤立窗口的问题
• 提高了在未保存的琼脂糖凝胶打开的情况下退出时的稳定性
• 提高了更改序列链时的稳定性
• 从 GenBank 导入时保留 division / sequence 类
• 修正了 macOS 上 Dock 菜单中文档有时重复的问题
• 修正了在“特征”和“引物”视图中与限定符和其他注释属互时，“编辑”菜单中的“全选”和“复制”指令未启用的问题
• 修正了将多行文本复制并粘贴到其他程序中的问题
• 确保注释的负位置正确显示在 Features （特征） 和 Primers （引物） 视图中
• 修正了激化SnapGene 时 File （文件） 菜单中的 Import作指示它们未解锁的问题
• 修正了阻止在多个序列对齐中打印特征的问题
• 现在，在 Features 或 Primers 视图中选择限定符其他注释属性可以减除文档选择以避免模棱两可的选择
• 修正了在不使用“项目”窗口时模拟琼脂糖凝胶时默认使用所有打开的文件而不是可见文档的问题
• 提高了模拟琼脂糖凝胶时更改 MW 标记物时的稳定性
• 在计算二级结构后将 RNA 文件标记为具有未保存的更改
• 改进了导入 VectorNTI 导出的 GenBank 文件时的稳定性
• 改进了导入 VectorNTI 数据库时的稳定性
• 修正了在 Windows 上的打印选项对话框后面显示有关打印到 PDF 的孤立窗口的问题
• 提高了在未保存的琼脂糖凝胶打开的情况下退出时的稳定性
• 提高了更改序列链时的稳定性
• 从 GenBank 导入时保留 division / sequence 类
• 修正了 macOS 上 Dock 菜单中文档有时重复的问题
• 修正了在“特征”和“引物”视图中与限定符和其他注释属互时，“编辑”菜单中的“全选”和“复制”指令未启用的问题
• 当存在多个尾随终止密码子时显示蛋白质特性
• 修正了由于未显示垂直滚动条而在某些 macOS 系统上与参考对齐的序列无法正确对齐的问题
• 确保在恢复祖先序列时保留文件扩展名
• 确保在对 GenBank 序列执行批量作时保留拓扑
• 修正了与未保存的 Gel 文档交互时出现的许多问题
• 修正了在只有一个 CPU 内核的计算机上执行查找相似 DNA 序列时可能发生的崩溃
• 打开 New File 选项卡时取消选择所有文件
• 确保在特征选项卡中显示准确的分子量
• 提高整体性能
• 修正了阻止更改新创建文件的默认作者的错误
• 确保共享许可证遵守空闲超时