ProMass for Xcalibur 5.1 发布：新功能与修正详解

ProMass for Xcalibur 发布说明

当前版本：ProMass STD/HR for Xcalibur，版本 5.1，发布日期 2025年3月6日

这是一个维护版本，修正了几个小问题，并为 ProMass 5 用户增加了一些不错的新功能。

新的 ProMass 5.1 安装程序仅支持 64 位 Windows 系统。如果需要 32 位兼容性，请使用 ProMass 5.0 或更早版本。

ProMass HR 功能改进： 在 ProMass HR 中，使用“附加元素”功能进行的 PPL 解卷积在特定情况下可能输出质量相同但强度不同的重复精准质量数。现在，仅保留重复质量数中强度蕞高的那个。

新增质量峰合并功能： 在 ProMass HR 中，新增了一项功能，允许用户在自定义的去同位素窗口内合并质量峰。可通过 -i 指令行参数访问 $peakLabel{IsoWidth} 变量。此功能可用于消减选定质量窗口内的去同位素假象。窗口内卫星峰的强度会加到蕞大峰上。例如，-i 3 会将窗口中所有质量数在蕞大峰 +/- 3 Da 范围内的峰合并。通常 3 Da 的质量窗口足以消减大多数去同位素假象。使用此功能需谨慎，以避免消减真实的杂质。如果去同位素假象普遍存在，这通常表明 PPL 分子式模板与所分析样品的分子式不匹配。

新增生物序列残基标记功能： 如果残基未在 znova_masses.ini 文件中定义，新增功能会自动在 ProMass 报告中将 BioSequence 残基以红色粗体文本标出。

修正托盘未定义错误信息： 修正在某些自动进样器上可能出现的托盘未定义错误消息。

修正特殊字符导致报告显示异常问题： 修正了原始文件名中包含特殊字符（#、@、! 等）会导致 ProMass 报告显示不正常的问题。

新增已知组分功能： 已知组分是独立的质量数（而非目标质量数的加和或扣除形式）的杂质。已知组分的质量数将添加到 znova_masses.ini 文件的 [knownComponents] 标题下。

新增多聚体自动识别能力： 如果已在杂质列表中定义，新增自动识别目标质量数多聚体的能力。例如，二聚体可输入为：dimer = 2M。若希望在纯度计算中忽略 ESI 气相二聚体的强度，则可输入：*gas phase dimer = 2M。

色谱图汇总表改进： ProMass 报告中的色谱图汇总表现在会显示色谱图中每个峰的基峰归属。

日志文件增加额外样品信息： 在日志文件中增加了额外的样品信息。

报告增加状态指示器字段： 在 ProMass 报告中增加了一个状态指示器字段，以进一步明确结果颜色代码的含义。启用此功能需使用 auto_proc_status.html 自动处理报告模板。

新增代码清理临时 PPL 文件： 在 ProMass HR 中增加了清理临时 PPL 文件的代码。

交互式谱图查看器缩放功能增强： ProMass 交互式谱图查看器现在可以通过在主谱图窗口上拖动来进行缩放。这允许更精细的缩放控制。主谱图下方的缩略谱图仍可用于缩放和平移。