snapgene

分子生物学软件

SnapGene是一款的多功能的分子生物学工具,能够直观的注释分析和DNA图谱,用于创建和共享的注释文件,帮助用户清晰地为分析生物学绘制相关图像。

 

SnapGene 6.0为处理克隆模拟、特征和琼脂凝胶提供了更大的灵活性。亮点包括用于静默添加或删除限制位点的新工具、对自定义特征类型的支持、可共享的琼脂糖胶文件以及为克隆模拟选择的片段的改进选项。

 

添加或删除酶位点的沉默突变

限制可以通过沉默突变自动在编码序列中添加或删除限制酶位点。

 

 

支持自定义特征类型

现在可以扩展可用特征类型集以包括自定义类型(非GenBank),并且可以更改默认特征颜色。

 

 

琼脂糖凝胶文件

琼脂糖凝胶模拟现在可以保存为.gel文件,以便日后查看和编辑凝胶或与他人共享。

 

 

成对和多重比对中的特征注释

成对和多序列比对现在支持可编辑特征,能够从比对视图或新特征视图添加、编辑和搜索。

 

 

克隆仿真增强

克隆模拟对话框的新灵活性使片段能够在克隆界面内添加、删除或重新排序。现在可以在模拟限制性克隆、Gibson Assembly、In-Fusion Cloning和NEBuilder HiFi Assembly时翻转向量。

 

 

新功能

  • 添加了通过沉默突变将酶位点添加到编码序列的工具

  • 添加了通过沉默突变从编码序列中删除酶位点的工具

  • 添加了对标准GenBank特征类型集中未包含的自定义特征类型的支持

  • 启用更改标准Genbank特征类型的默认颜色

  • 添加了对将琼脂糖凝胶模拟保存和加载为.gel文件的支持

  • 添加了对成对对齐中的功能的支持

  • 启用在路线中添加、编辑和删除要素

  • 查看成对和多序列比对时添加了一个特征表

  • 启用搜索路线以查找功能

  • 增强的Gibson、InFusion和NEBuilder HiFi Assembly仿真工具允许翻转矢量

  • 增强的克隆模拟工具支持添加、删除和重新排序序列

  • 包括根据酶切割的次数和相对于其识别序列的相对位置过滤所选酶集的控件

  • 启用设置默认密码子使用表

  • 添加了用于在DNA计算对话框中将ng/uL转换为nM的工具

  • 将碱基计数添加到DNA计算对话框

 

增强功能

  • 增强了”Blocks of 3“序列视图格式,使核苷酸三联体与阅读框对齐

  • 支持在打印成对和多序列比对时选择性地在序列旁边显示序列名称

  • 从“?”切换翻译中的“X/Xaa“代表不明确的氨基酸

  • 为ssDNA序列中的选定区域添加了Tm

  • 添加了一个锁定机制,该机制在编辑文件时将文件设置为对SnapGene的其他实例只读。注意锁定机制对大文件不可用,延迟时间短,所以在文件同时打开时无效

  • 导入或创建新RNA序列时将Psi转换为U

  • 添加了对导出引物数据时包含结合位点位置的支持

  • 添加了Gateway Cloning目标载体pEXP3-DEST和pEXP4-DEST,并更新了pEXP-DEST载体描述中的交叉引用

  • 在复制和粘贴到“新蛋白质文件”对话框,或插入或替换蛋白质序列中的残基时,现在保留特征和自定义编号

  • 添加了对粘贴复制的互补引物对以配置琼脂糖凝胶泳道的支持

  • 改进了关于在限制性克隆期间酶被阻断时如何改变序列甲基化的解释

  • 添加了对从命令行界面导出地图时调整分辨率 (ppi) 和创建透明图像的支持

  • 包括各种文本增强

 

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