GraphPad Prism是一款可视化的数据分析软件，可以帮助科学研究人员和实验室人员进行统计学分析、绘制高质量的统计图表、执行回归分析、以及进行其他常用的数据分析和可视化任务。

DNADynamo 是面向分子生物学实验流程的 DNA 测序与序列分析软件，可用于序列导入、带注释序列文件检索、测序数据组装、突变分析、克隆方案设计、引物设计、PCR 模拟、质粒图绘制、DNA 与蛋白质多序列比对、BLAST 检索、GenBank 文件检索和 PDB 结构文件显示，支持 Windows、Mac OSX 和 Linux 环境，并支持跨系统文件兼容。

Lynnon Biosoft 为激动人心的基因组科学的教育、研究和开发开发和销售生物信息学软件平台。DNAMAN 为序列分析和数据挖掘提供了一个有效的工具包。

DNASTAR激光基因用于分子生物研究、蛋白质分析、基因组学和转录组学研究的序列分析软件。

PrimerPlex是一种高效且复杂的工具，用于设计多重PCR的引物。多重分析有助于在单个反应容器中扩增多个目标，从而减少试验时间和成本。

Beacon Designer是一个qPCR工具，用于为SYBR Green、TaqMan、HRMA、LNA spiked TaqMan、MethyLight TaqMan、molecular beacons、Scorpions和FRET分析设计高效和特异性寡核苷酸。

Sequencher是DNA 序列分析的工业标准软件。它可以和全部自动序列分析仪一同工作，并且因为它的Contig 组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具，以及突出的技术而众所周知。

OLIGO Primer Analysis Software 是设计和分析测序和 PCR 引物、合成基因以及包括RNA 和分子信标在内的各种探针的必备工具。

USEARCH是一款序列分析软件，在序列比对、聚类、操作等多领域被广泛的应用。在扩增子分析领域的OTU聚类非常受欢迎。该软件由Robert Edgar开发，在序列搜索、聚类、去重、去嵌合体等步骤的度以及效率上。

Geneious是一款综合、跨平台的生物信息学软件，包括操作、发现、共享和探索生物数据，例如DNA序列或蛋白质，系统进化，三维结构信息，出版文献等。它的功能包括序列比对和系统学分析，毗连群，引物设计和克隆和限制性分析，使用NCB和EMBL，BLAST，蛋白质结构查看，自动化医学搜索等。它甚至包含了一个API，您可以创建您的个人生物信息插件。